หลังการแต่งงานกับกษัตริย์แห่งอารากอนถูกประกาศเป็นโมฆะ พระราชินีเลโอนอร์เกษียณตัวกลับมาอยู่ที่ราชอาณาจักรกัสติยา พระองค์ไปอยู่ที่อารามซานตามารีอาลาเรอัลเดลัสอูเอลกัสเพื่อสมทบกับเบเรงเกลา พระเชษฐภคินีที่ได้เกษียณตัวจากการปกครองกัสติยาและเลออน และกอนส์ตันซา พระขนิษฐาที่เป็นแม่ชีที่อารามดังกล่าวมานานแล้ว สามพี่น้องสิ้นพระชนม์ที่นั่น กอนส์ตันซาสิ้นพระชนม์ในปี ค.ศ. 1243 เลโอนอร์สิ้นพระชนม์ในปี ค.ศ. 1244 ส่วนเบเรงเกลาสิ้นพระชนม์ในปี ค.ศ. 1246[5] ร่างของสามพี่น้องถูกฝังในอารามดังกล่าว